נולד בירוחם למשפחת עולים ממרוקו, הצעיר מבין תשעה אחים. שירת כקצין קרבי בגולני והיה אחד הצוערים בקורס קצינים אחריהם עקב הסרטלהיות קצין.

את דרכו החינוכית החל כשהקים, עם שחרורו מצה"ל, קבוצות הכנה לצה"ל בירוחם. הוא הדריך חוגי סיירות במסגרת מל"ש (מרכז לימודי שדה) ירוחם, עסק בפיתוח תוכניות לקידום נוער, ושימש כחבר הוועד המנהל שלהמכללה האקדמית לחינוך ע"ש קיי, ויו"ר הוועד המנהל של עמותת "עתיד במדבר" - מוסד להעצמה קהילתית וחינוך יהודי פלורליסטי. החל מ-2010 משמש ביטון כיו"ר דירקטוריון החברה הכלכלית לפיתוח ירוחם, ומשנת 2012 כחבר הדירקטוריון של החברה למתנ"סים.

ביטון הוא מייסד עמותת "צעירים בירוחם" לעידוד התיישבות, מנהיגות ומעורבות של צעירים בירוחם ובנגב. כמו כן שימש כיו"ר עמותת "עתיד במידבר" לעידוד פלורליזם ולמידת מקורות היהדות על גווניה, תוך התמקדות ביצירה ובמעורבות קהילתית. כמו כן ייסד את עמותת "קלי"ר - קהילה למען ילדי ירוחם" שפעלה בשנים 1998-2002.

משמש כיום קצין קרבי בדרגת סרן בצה"ל בשירות מילואים פעיל. בוגר תואר ראשון במדעי ההתנהגות מאוניברסיטת בן-גוריון, תעודת הוראה מטעם מכון מנדל למנהיגות, ותואר שני בניהול מלכ"רים באוניברסיטה העברית. שימש בשנים 2000-2003 כמנהל מתנ"ס ירוחם ומנהל מרכז לימודי שדה (= מל"ש) נתיבות. כן שימש בשנים 2003-2005, כמנהל אזור באר שבע - בני שמעון של הסוכנות היהודית. בשנים 2005-2006 שימש מנהל תכנון ופיתוח של מגבית קנדה בישראל.

ביטון הוא מגשר ובוגר קורסי מנהלים של החברה למתנ"סים ושל הסוכנות היהודית, ובוגר תוכנית "גוונים" למנהיגות יהודית פלורליסטית בישראל.

בבחירות שנערכו בירוחם ב-23 בנובמבר 2010, זכה ביטון ברוב של 44.5% מקולות המצביעים ונבחר לראש מועצת ירוחם מטעם הרשימה העצמאית "ירוחם אחת" כמחליפו של יו"ר הוועדה הקרואה עמרם מצנע.

ב-10 באוקטובר 2012 הכריז מיכאל ביטון על הצטרפות למפלגת העבודה הישראלית בראשות שלי יחימוביץ' לקראת הבחירות לכנסת ה-19 והוצב במקום ה-104 ברשימתה לכנסת.

ב-11 בנובמבר 2014 נבחר ביטון לכהונה שנייה כראש מועצת ירוחם לאחר שזכה בכ-70% מקולות הבוחרים.

ביוני 2015 מונה ביטון ליושב ראש מועצת הנגב.

נשוי לאילנה ואב לחמישה ילדים. מתגורר בירוחם.